化学とAI マテリアルズインフォマティクスに使える約50のデータベース
マテリアルズインフォマティクスを実践する上で何より重要なものはデータです。そのため、各分野でデータベースが充実されつつあります。この記事では、代表的なデータベースを紹介します。 マテリアルズインフォマティクスのためのデータベースは４種類に分...
化学とAI
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化学とAI マテリアルズインフォマティクスとは？ データをもとにした材料開発を高速化・効率化する技術
マテリアルズインフォマティクス（MI）とは？ マテリアルズインフォマティクスは、データをもとに統計的な手法を利用した精度の高い材料の物性の予測や、目標とする物性の材料の予測によって、従来の実験科学的な手法をサポートして材料開発を高速化・効率...
化学とAI マテリアルズインフォマティクスのやり方をわかりやすく説明
ねこ マテリアルズインフォマティクスってどうすればできるの？ けむさん マテリアルズインフォマティクスのやり方をわかりやすく説明します マテリアルズインフォマティクスのやり方の概要 マテリアルズインフォマティクスには順問題と逆問題の２種類が...
化学とAI ニューラルグラフフィンガープリント（Neural Graph Fingerprints）
ニューラルグラフフィンガープリント（Neural Graph Fingerprints）はサーキュラーフィンガープリントの一種です。 同じサーキュラーフィンガープリントにはECFPがあります。ECFPは前のレイヤーのarrayを次のレイヤー...
化学とAI ECFP（Extended-Conectivity Fingerprints）の生成プロセス
ECFPはサーキュラーフィンガープリントの一種です。この記事では、分子記述子のひとつであるECFPについて、意味や生成プロセスを説明します。 ECFPは構造活性相関のための分子記述子として広く利用されています。その生成プロセスを知っておくと...
化学とAI 分子記述子とは？ 化学構造のベクトル化表現 マテリアルズインフォマティクスに利用
分子記述子とは何でしょうか？ いったい何に使うものでしょうか？ 分子記述子は化学構造の特徴をベクトルで表現したものです。化合物の類似性を比較する場合や、マテリアルズインフォマティクスで化合物の物性予測をする場合などに使用します。化合物の特徴...
化学とAI 化学構造式をInChI表記やInChI Keyに変換する方法
通常、化合物は複数の名前の付け方ができます。例えば「CH3COOH」は、慣用名の酢酸（Acetic acid）と系統名のエタン酸 （Ethanoic acid）のどちらの表現も正しいです。ただ、化合物のデータベースを作る際は化合物と名前が1...
化学とAI 化学構造式をSMILES表記に変換する方法
化学において機械学習を利用する場合、化学構造式をSMILES表記に変換し、モレキュラーフィンガープリントとして利用して学習させることがあります。また、各国の化学品管理で化合物を登録する際に、化合物名やCAS番号とともにSMILES表記を記入...
化学とAI Morganアルゴリズムとは？ 分子内の原子の優先順位をつけるアルゴリズム
Morganアルゴリズムとは？ Morganアルゴリズムは、分子内の原子の優先順位をつけるためのアルゴリズムです。SMILES表記を一意に決めるためのcanonical SMILESにも利用されています。 Morganアルゴリズムのルール ...